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中国荷斯坦牛基因组选择育种芯片发布,产量第一的奶牛自主培育效率升级

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中国荷斯坦牛基因组选择育种芯片发布,产量第一的奶牛自主培育效率升级

荷斯坦奶牛是世界公认产量最高、产奶经济性最高的奶牛品种。专家一致认为,参照国际同类产品标准,中国自主研发的这款育种芯片可用于奶牛基因组选择参考群体的构建及种牛评价。

界面新闻记者 | 实习记者 朱彬

近日,第三十届中国北京种业大会上,荷斯坦牛中高密度基因组选择育种芯片发布,我国荷斯坦牛中高密度育种芯片自主设计开发取得突破。荷斯坦牛中高密度育种芯片的研发,有助于提升中国荷斯坦牛自主育种效率。

荷斯坦奶牛是世界公认产量最高、产奶经济性最高的奶牛品种,原产于荷兰北部,其后代分布到荷兰全国乃至法国北部及德国的荷斯坦省,后引入美国、加拿大等国家。但因其属于单胎动物,繁殖周期长,因此全球均以“本品种纯繁、持续改良”为群体改良的核心策略。

1985年,经过从国外引种、国内驯化培育等长期选充过程,我国最终培育成功“中国荷斯坦牛”品种。但整体而言,我国奶牛育种与国外存在一定差距,主要表现为奶牛繁育基础工作相对薄弱、奶牛核心种源自主培育能力不强、基因组选择遗传评估的准确性亟待提高、奶牛良种快速扩繁技术效率低、奶牛冷冻精液产品的质量监管不完善。中国农业大学动物科技学院教授孙东晓认为。

尤其在育种技术上,一直以来,国内奶牛核心种源自主供种能力较弱,仍主要引进国外选育技术。“十四五”国家重点研发计划项目首席科学家、中国农业大学教授孙东晓接受新华社记者采访时表示,“我国近年来加速构建和优化奶牛基因组选择育种技术平台,但过去完全依赖国外育种芯片,国内种牛检测样品需要送到国外实验室检测,存在技术‘卡点’及生物信息安全风险”

而国外近年来早已进入奶牛基因组选择育种时代,中高密度育种芯片的运用能缩短种公牛培育周期至2年左右,育种效率更高。

近年来,我国不断提升优秀种牛自主培育能力。2020年8月13日,首农食品集团北京奶牛中心、中国农业大学、华智生物技术有限公司三方合作,启动荷斯坦牛育种芯片自主开发攻关工作。2021年4月,攻关团队完成奶牛85K液相育种芯片自主开发,并通过专家论证。通过6000头荷斯坦牛样本对比检测验证,该款芯片在检出率、分型准确性、基因型填充准确性等性能上与国际商业化育种芯片一致。

2022年以来,攻关团队进而将奶牛85K液相育种芯片扩容升级为126K芯片,该款芯片不仅兼容现有参考群和多款商业化芯片位点信息,还提高了芯片数据填充准确性及奶牛基因组遗传评估准确性。

2023年7月14日,奶牛126K液相基因组育种芯片通过了专家论证,专家组一致认为:该芯片设计科学合理,涵盖120,155个位点,SNP平均间距为22.13kb、分布均匀,包含自主挖掘、国际通用亲子鉴定、遗传缺陷以及相关重要已知功能位点,经过检测验证、盲样复检、多平台对比、填充效果验证等多轮测试,验证程序完善。参照国际同类产品标准,该款芯片可用于奶牛基因组选择参考群体的构建及种牛评价。芯片检测平台技术成熟,自动化和自主化程度高,建议推广使用。

华智生物技术有限公司副总裁王朝晖认为,此款126K芯片的广泛应用,将进一步提升我国奶牛自主选育能力,助力奶牛种业振兴。

未经正式授权严禁转载本文,侵权必究。

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中国荷斯坦牛基因组选择育种芯片发布,产量第一的奶牛自主培育效率升级

荷斯坦奶牛是世界公认产量最高、产奶经济性最高的奶牛品种。专家一致认为,参照国际同类产品标准,中国自主研发的这款育种芯片可用于奶牛基因组选择参考群体的构建及种牛评价。

界面新闻记者 | 实习记者 朱彬

近日,第三十届中国北京种业大会上,荷斯坦牛中高密度基因组选择育种芯片发布,我国荷斯坦牛中高密度育种芯片自主设计开发取得突破。荷斯坦牛中高密度育种芯片的研发,有助于提升中国荷斯坦牛自主育种效率。

荷斯坦奶牛是世界公认产量最高、产奶经济性最高的奶牛品种,原产于荷兰北部,其后代分布到荷兰全国乃至法国北部及德国的荷斯坦省,后引入美国、加拿大等国家。但因其属于单胎动物,繁殖周期长,因此全球均以“本品种纯繁、持续改良”为群体改良的核心策略。

1985年,经过从国外引种、国内驯化培育等长期选充过程,我国最终培育成功“中国荷斯坦牛”品种。但整体而言,我国奶牛育种与国外存在一定差距,主要表现为奶牛繁育基础工作相对薄弱、奶牛核心种源自主培育能力不强、基因组选择遗传评估的准确性亟待提高、奶牛良种快速扩繁技术效率低、奶牛冷冻精液产品的质量监管不完善。中国农业大学动物科技学院教授孙东晓认为。

尤其在育种技术上,一直以来,国内奶牛核心种源自主供种能力较弱,仍主要引进国外选育技术。“十四五”国家重点研发计划项目首席科学家、中国农业大学教授孙东晓接受新华社记者采访时表示,“我国近年来加速构建和优化奶牛基因组选择育种技术平台,但过去完全依赖国外育种芯片,国内种牛检测样品需要送到国外实验室检测,存在技术‘卡点’及生物信息安全风险”

而国外近年来早已进入奶牛基因组选择育种时代,中高密度育种芯片的运用能缩短种公牛培育周期至2年左右,育种效率更高。

近年来,我国不断提升优秀种牛自主培育能力。2020年8月13日,首农食品集团北京奶牛中心、中国农业大学、华智生物技术有限公司三方合作,启动荷斯坦牛育种芯片自主开发攻关工作。2021年4月,攻关团队完成奶牛85K液相育种芯片自主开发,并通过专家论证。通过6000头荷斯坦牛样本对比检测验证,该款芯片在检出率、分型准确性、基因型填充准确性等性能上与国际商业化育种芯片一致。

2022年以来,攻关团队进而将奶牛85K液相育种芯片扩容升级为126K芯片,该款芯片不仅兼容现有参考群和多款商业化芯片位点信息,还提高了芯片数据填充准确性及奶牛基因组遗传评估准确性。

2023年7月14日,奶牛126K液相基因组育种芯片通过了专家论证,专家组一致认为:该芯片设计科学合理,涵盖120,155个位点,SNP平均间距为22.13kb、分布均匀,包含自主挖掘、国际通用亲子鉴定、遗传缺陷以及相关重要已知功能位点,经过检测验证、盲样复检、多平台对比、填充效果验证等多轮测试,验证程序完善。参照国际同类产品标准,该款芯片可用于奶牛基因组选择参考群体的构建及种牛评价。芯片检测平台技术成熟,自动化和自主化程度高,建议推广使用。

华智生物技术有限公司副总裁王朝晖认为,此款126K芯片的广泛应用,将进一步提升我国奶牛自主选育能力,助力奶牛种业振兴。

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