二价HPV疫苗持续受到九价HPV疫苗扩龄（九价疫苗扩龄到9-45岁，使得它成为市场的首选）等方面的市场竞争。另一方面，2023年，二价HPV疫苗在中国的接种对象扩展到9-14岁的女性，接种计划从三针减少到两针，降低了接种成本亦降低了相关市场需求。

万泰生物的二价HPV疫苗“馨可宁”是中国首个国产二价HPV疫苗，起初由于填补了市场空白，其销售业绩曾经非常亮眼。2023年开始，万泰生物来自二价HPV疫苗收入开始下跌；当年公司疫苗板块收入39.60亿元，同比减少53.37%；毛利率91.60%，同比减少2.29个百分点。

HPV疫苗市场竞争尚无缓和迹象，不过万泰生物仍期待其九价HPV疫苗的批准。根据年报披露，公司九价HPV疫苗III期临床试验和产业化放大进展顺利，III期主临床试验V8期访视的现场工作已完成。冻干水痘减毒活疫苗、20价肺炎疫苗等产品也处于研发序列。

目前公司市值仍超800亿元，处于相对高估区间。